截止目前，国家出台的各项化肥政策，归纳起来可分为以下2类：一类是各项优惠和扶持政策，如化肥生产用电、用气优惠，化肥铁路运价优惠，免征增值税等；另一类是各项调控和限价政策，如对尿素实行中准价和上浮幅度限制、二铵最高出厂限价，化肥经营差率控制，化肥出口征收100%-135%的关税等。
事实证明，国家出台的这些化肥政策对维护“三农”利益、调动农民积极性、稳定国内化肥价格和促进粮食生产起到了积极的作用，特别是近1年多来，国家连续大幅上调化肥出口关税，严控化肥出口，基本保证了国内农业生产用肥，防止了国内肥价与国际市场一起同步大幅飚升，使国家一系列惠农政策的作用得到了较好发挥。尽管如此，现有的化肥政策仍未从根本上解决化肥、粮食、三农、资源、能源等相关要素之间的一系列根本矛盾，有的是不得已而为之的权宜之计，没有从根本上摆脱“一管就死，一放就乱”的老路。而且，要想实现预期的调控目标，仅靠化肥一个行业显然是不够的，需要相关各行业的共同努力和一系列的配套措施和政策。
现行化肥政策面临的问题
受管制的化肥价格与上下游产品价格放开的矛盾。
由于化肥是农业生产所需的主要生产资料，其价格的变化直接影响到农民的种粮成本，影响到粮价的稳定，进而影响到社会的稳定。因此，长期以来国家对化肥价格的变化格外关注，只要肥价出现大幅上涨，国家肯定会出台相关的调控政策和限价措施。
然而，与化肥有关的上下游产品、原料、能源的价格则大多已经放开，其价格随供求关系的变化而波动，一旦这些上游原材料价格出现上涨，化肥生产成本就会上升。近2年来，化肥生产所需的煤炭、天然气、磷矿石、硫磺、硫酸、合成氨、钾肥等价格均大幅上涨，特别是进口硫磺、钾肥的涨幅十分惊人，这导致化肥的生产成本成倍地增加。按理，化肥成本上升会导致肥价上涨，但由于国家对化肥实行了限价，化肥成本的上升无法向下游市场和产品转移，即使下游产品如粮油、蔬菜、水果价格出现上涨，能够完全或部分消化化肥价格的上涨，而化肥限价破坏了价格形成机制，人为地割裂开了上、中、下游产品之间的价格链。虽然国家对化肥的限价也会结合实际作适当调整，但调整的程序复杂、幅度有限、时间严重滞后，使企业无法适应市场竞争。
在这种情况下，企业往往在成本上涨尚能承受时，尽可能地执行国家限价，但随着成本的继续上升，如继续执行限价就会出现较大的亏损，企业就会采取变通的方式上调价格，使限价名存实亡，如目前仍在实行的1725元/吨(1500元/吨上浮15%)的尿素最高出厂限价就是如此，目前尿素实际价格已经达到2200-2300元/吨甚至更高；再如二铵在2008年春耕期间的最高出厂限价是4100元/吨，而实际价格则达到了4400元/吨以上。而且，由于企业变通涨价实质上是违规行为，故涨价的时间、数量、幅度、范围、对象等均受到制约，无法将真实的成本完全向下游产品转移。
原料、能源、运输的政策优惠价与正常市场价并存的矛盾。
目前，大型化肥企业生产用电、气均享受计划内的优惠价，化肥铁路运输享受2号特殊优惠运价，并免征铁路建设基金，这几项优惠政策每年将使化肥企业受惠约150亿元，这对降低化肥成本、稳定肥价起到了一定的作用。但是，随着煤炭、石油、天然气、电力价格逐步放开，这就形成了现实中的价格'双轨制'，由于计划价大大低于市场议价，这些原料、能源生产企业不愿意将产品卖给享受优惠价格的化肥企业，使化肥企业的生产用电、用气难以得到保障，多数化肥企业都不同程度地存在生产用电、用气供应不足，导致生产不能满负荷。在运输方面，铁路部门在运力紧张时，往往会优先安排运价较高的煤炭、钢铁的运输，使享受优惠运价的化肥运输受到影响。
政府限价“一刀切”与化肥价格地区差、季节差的矛盾。
政府对化肥限价往往是“一刀切”的方式，即全国市场、所有企业、一年四季、一个限价，但是，由于各个化肥企业的生产工艺、原料路线的不同，生产成本差异很大，以尿素为例，可分为以煤、天然气、石油为原料的3种类型，煤头尿素企业的成本最低、气头企业次之、油头企业成本最高，在煤炭价格没有大幅上涨的2007年以前，这三种类型尿素企业的成本高低差异在400-500元/吨甚至更多，油头尿素企业的成本在1700元/吨以上，而煤头企业成本只有1300元/吨左右，这样，不同成本的企业同样执行1725元/吨的最高出厂限价，油头企业就会亏损，而且承受价格波动的能力相当弱，正因如此，多数油头尿素企业已经实现了“油改煤”。即使同样都是以煤为原料的企业，由于工艺设备、生产管理的不同，其成本也有差异。
此外，化肥价格在不同的季节也是有涨有落的，一般在淡季用量少、价格会走低，在旺季用量大、价格会走高，而且生产和流通企业在淡季储备化肥必然要增加成本，因此在淡季结束后的用肥旺季适当提高肥价完全是合理的。但是，化肥价格受成本、季节等因素影响而上下波动，涨的时候就可能超过限价，跌的时候则可能低于限价，而只要超出限价就是违规。因此，政府“一刀切”的限价方式，一方面削平了不同成本的化肥企业化肥价格上的地区差，使一些由于客观原因导致成本较高的化肥企业经营效益下降，甚至出现亏损；另一方面使化肥价格不能真实反映供求关系的变化，使生产、流通企业淡储化肥增加的成本在价格上得不到体现。
国内肥价要求相对稳定与国际化肥及原料价格大幅飚升、急剧震荡的矛盾。
为了保障国家的粮价稳定和粮食安全，我们要求国内的化肥价格应保持相对稳定，不能大起大落，以促进农业的稳步发展。
但是，近2年来，国际市场化肥及其原料价格大幅飚升，严重影响了国内化肥成本、价格的稳定，目前国际市场二铵FOB价格上涨4倍达到1200美元/吨，尿素FOB价格达到700美元/吨。国际肥价的飚升导致国产尿素、二铵、一铵大量出口，造成国内化肥资源不足，价格飚升，影响了农业生产，而严重依赖进口的钾肥、硫磺资源则成为国内本轮化肥价格大幅飚升的罪魁祸首，1年多来，进口氯化钾价格上涨2倍达到现在的5000元/吨，进口硫磺价格上涨10倍达到现在的6000元/吨，这使二铵成本大幅上涨到目前的4600元/吨以上，而国际煤炭价格大幅上涨也带动国内煤价的上涨，使尿素企业成本压力与日俱增。
虽然我们对化肥进行限价，但是因钾肥、硫磺价格飚升导致化肥成本大幅上涨是我们无法控制的，化肥成本的不断上升就会推动肥价不断上涨，最终使政府限价陷入名存实亡的尴尬境地。
氮肥、磷肥产能过剩和国内需求有限的矛盾。
2008年4月中旬，国家出台了对所有化肥加征100%临时出口关税的政策，以保证春耕化肥供应，并要求铁路部门在