为保护农民利益，调动农民的种粮积极性，确保国家粮食安全，自2004年以来，我国一直对化肥实现限价政策，今年更是将限价范围扩大到了除钾肥外的所有化肥品种，同时加大了价格检查与监管力度，无论是检查的批次与频率，还是检查的范围，参加的检查人员人数，今年都是最多的，可以说今年是政府部门对化肥价格的监管力度最大的1年，但仍挡不住化肥价格的疯狂上涨。从目前情况看，将化肥价格控制在限价内的难度极大。主要原因有以下两点：
一是煤炭等原材料价格大幅上涨极大地推动了化肥生产成本上涨。据安徽合肥市物价局到四方集团等企业调查，主要化肥产品的原材料价格目前是涨声一片，尤其以今年4、5月份为甚，几乎达到了每隔几日就有相应的原材料价格或其他制造费用上涨的地步。例如：尿素的主要原材料块煤和烟煤2007年5月份的价格为900.46元/吨、478.42元/吨，2008年5月份为1180.1元/吨、 636.2元/吨，分别上涨了31.06%、32.98%；复合肥（25%浓度）的主要原材料普钙（12%）、磷铵、氯化钾（国产）2007年5月份的价格分别为404.2元/吨、1977元/吨、1963元/吨，2008年5月份为821元/吨、3950元/吨、4700元/吨，分别上涨了103.12%、99.80%、139.43%；复合肥（45%浓度）的主要原材料普钙（14%）2007年5月份的价格为472元/吨，2008年5月份为958元/吨，上涨了102.97%。原材料价格上涨使得化肥生产成本急剧增加，以合肥四方集团为例：尿素在2007年第1季度的单位生产成本为1892.8元/吨，2008年1季度为2011.76元/吨，上涨了6.28%；复合肥（25%浓度）2007年3月份的单位生产成本为922.18元/吨，2008年3月份为1472.15元/吨，上涨了59.64%；复合肥（45%浓度）2007年3月份的单位生产成本为1643.6元/吨，2008年3月份为2811.0元/吨，上涨了71.03%。
再如湖南，据湖南省石化行业办统计，今年上半年，湖南尿素平均生产成本高达2320元/吨，按省内最高限价1825元/吨，再加上每吨60元的补贴计算，每吨尿素亏损435元。为此，湖南省经委、省石化行办、省供销社等职能部门提出应对措施和建议：一是严格控制煤炭、硫铁矿、磷矿、钾肥等化肥生产原（燃）料价格；二是尿素按季节每吨分别补贴200元和500元，要保证价格补贴及时到位，鼓励企业生产积极性。
二是化肥价格的检查手段与查处力度远远不够。按道理说，限价政策制订后，政府部门就应该大力加强对化肥市场的检查，确保限价得到有效的执行。但从实际情况看，化肥限价的执行情况很差。主要原因有二，其一是限价标准过低，主要氮肥产品尿素的出厂价格采用的还是2006年确定的价格，每吨不超过1725元。但是，近年来化肥用煤炭、天然气和电力的价格却在上涨，煤炭价格翻了1倍左右。在成本推动下，1～5月份氮肥行业亏损企业亏损额同比增长40.63%。其二是政府部门缺乏有效的价格监管手段，使得价格检查形同虚设，尽管形式上轰轰烈烈，一大堆人马大张旗鼓地到企业、到化肥批发市场、到化肥零售点检查，但实际效果却很差。目前化肥价格从出厂价到批发价到零售价全面超限，但物价部门又查处了几起超限案件呢？又对几家单位进行了处罚呢？农民对此意见很大。应该说，目前这种常规的化肥价格检查手段是远远不够了，处罚力度也远远不够，远远不能适应形势的发展，应该加以彻底改进，特别是在检查机制上要有新的突破。