随着磷矿资源省不断出台控制磷矿出省的措施，磷矿供应日趋紧张，原本紧缺的磷矿资源更加身价不菲，就连那些品位较低的磷矿原料也一时成为企业的抢手货。受地理条件、市场、运输、价格、品质等诸多因素的限制，目前浙江磷肥、复混肥企业发挥生产能力还不到50%。
由于浙江是一个没有磷矿资源的省份，其所用磷矿主要依靠外省。近年来，随着资源地磷肥工业的快速发展以及有关资源保护政策的出台，磷肥生产原料供应的紧缺局面一再加剧。这是浙江磷肥企业开工不足的一个重要原因。据巨化硫酸厂厂长薛家保介绍，生产原料供应量受限导致成本增加，致使磷肥企业的利润空间不大。如30%品位磷矿吨价自两年前由300元涨到500多元后，至今未有回落，这严重挤压了企业的利润空间。因此，2006年，浙江已有绍兴复合肥厂、嘉兴神农肥料有限责任公司等6家企业因生产磷肥已无利可图先后停产。前一时期，湖北省磷矿石价格调节基金正式征收后，该省磷矿石涨价幅度较高，浙江一些小企业也因此受到严重影响。杭州航民有机复合肥有限公司已基本停产。每年需从云南、贵州等地购进10多万吨磷矿的巨化硫酸厂，目前2条复合肥生产线也只有单线投入生产。
导致浙江磷肥企业开工不足的另一个重要原因是市场混乱。市场分析表明，浙江过磷酸钙为低浓度磷肥，几乎全部销在省内销售，市场供大于求。该省复混肥年产量60多万吨，基本与省内农业施用量相当，但省内生产的复混肥特别是高浓度复混肥有一半以上销往了省外，销往省内的磷肥产品仅占市场约1/3。由此形成磷矿资源千里迢迢从外地运进来，本省的产品又大量拉往省外销售的怪现象。在这种状况下，浙江磷肥行业生产长期徘徊不前，现有30多万吨生产能力的高浓度复合肥，发挥能力只在60%～70%。