2023年，新疆大学科研创新能力稳步提升。该大学加强有组织科研，持续推进科研平台建设，着力提升科研成果水平，培育重大项目和重大成果。学校获各类科研项目1257项，较2022年增长111%，科研经费总额6.7亿元，较2022年增长33%。获批省部级科研平台4个，获批自然资源部创新团队1个，教育部联合基金创新团队1个，自治区级天山创新团队6个。出版专著28部，人文社科各单位发表高水平论文347篇，理工科各单位共发表高水平科研论文978篇，获自治区科学技术奖14项。
特别是2023年12月，国家重点研发项目“煤炭清洁高效利用技术”专项“哈密煤直接转化制备高端精细化学品技术”获批。该项目由新疆大学牵头，联合煤炭科学技术研究院有限公司、新疆宣东能源有限公司、大连理工大学、华东理工大学、中国科学院工程热物理研究所等10家高校、企业共同申报，项目总投入9993万元，实施周期为5年。